В конце XVIII – начале XIX века владение, на котором находится Центральный дом ученых, принадлежало Ивану Петровичу Архарову, московскому военному губернатору. В 1818 его купил князь Иван Александрович Нарышкин, бывший одной из знаковых фигур светской Москвы того времени. На венчании Александра Сергеевича Пушкина и Натальи Николаевны Гончаровой, Нарышкин присутствовал в качестве посаженного отца невесты (будущая жена великого поэта была племянницей князя). Разумеется, молодая чета очень часто бывала в доме на Пречистенке. Позже, уже когда особняк принадлежал Мусину-Пушкину, сюда приезжал Николай Васильевич Гоголь, работавший тогда над вторым томом «Мертвых душ».
На протяжении XIX века особняк несколько раз менял владельцев и перестраивался. В 80-х годах его обновлением занялся известный архитектор Анатолий Оттови Гунст: он практически полностью разрушил старое здание и с большим размахом возвел новое. Здание считается одним из бриллиантов неоклассицизма начала ХХ века. Гунст украсил фасад фронтоном и шестью пилястрами ионического ордера. Особой роскошью отличалось внутреннее убранство дома, однако после прихода советской власти обстановка стала куда более скромной, а все «излишества» были национализированы. В 90-е годы особняк был реставрирован и вернулся к первозданному облику. Вновь распахнули двери Большой зал, фойе и гардероб.
Сам Дом ученых был создан в 1922 году. У его истоков стояли академики С.А. Чаплыгин, Б.А. Рыбаков, Б.Д, Греков, И.И. Минц, В.А. Энгельгардт, В.Н. Образцов, Н.Д. Зелинский, И.И. Бадин и другие. Медицинскую секцию в Доме возглавил лично Народный комиссар здравоохранения РСФСР Н.А. Семашко.
В Доме ученых постоянно открывались новые секции и кружки. Сегодня Центральный Дом ученых Российской академии наук по праву считается культурным и научным центром страны, здесь постоянно работают 36 научных секций, кружки и студии, в которых задействовано несколько тысяч человек. Есть собственный народный симфонический оркестр, хор, школы иностранных языков и др. Здесь регулярно проходят творческие вечера известных ученых, писателей и артистов, приезжают с гастролями известные театральные и музыкальные коллективы.